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Equipe 3 « Interactions, Dynamique et Drug Design - ID3 »

par Webmaster - 11 mars 2009

Responsable : Xavier Morelli

Composition de l’équipe 2008

Permanents :

  • X. Morelli (CR1, CNRS)
  • P. Roche (CR1, CNRS)
  • V. Receveur-Bréchot (CR1-CNRS)
  • M.J. Basse (TCS-CNRS)

Non Permanents :

  • A. Lugari, 1ère année de thèse BBSG, bourse de l’Agence Nationale de Recherche pour le SIDA - Directeur de thèse Xavier Morelli.
  • X. Shi, 1ère année de thèse, bourse de l’Ambassade de France en Chine - Directeur de thèse Xavier Morelli.
  • R. Bourgeas, 1ère année de thèse BBSG, boursier du ministère - Directeur de thèse P. Roche.

Le thème principal de notre équipe, crée début 2008, est l’étude des principes fondamentaux régissant les paramètres de la reconnaissance moléculaire (principalement des complexes protéine-protéine et protéine-sucre). Nous nous proposons d’étudier plus particulièrement la dynamique moléculaire lors de la formation de complexe, leur structure libre et/ou liée, et de proposer des protocoles opératoires innovants permettant leurs inhibitions spécifiques. Les méthodologies choisies concernent essentiellement des méthodes de biologie structurale (RMN en collaboration avec le groupe de F. Guerlesquin, Rayons X), de biophysique (SAXS et microcalorimétrie) et d’informatique (modélisation, dynamique moléculaire, docking protéine-protéine et protéine-ligand). Les thématiques biologiques abordées sont centrées autour de projets fondamentaux : reconnaissance moléculaire de protéines désordonnées (ou domaines protéiques), étude des paramètres de spécificité d’interaction protéine-protéine (complexes impliquant un domaine SH3 en interaction avec plusieurs protéines ‘Nef-like’) ou bien encore dans l’étude de complexes impliqués dans une réponse à un stress cellulaire (complexe thiorrédoxine/thiorrédoxine réductase en collaboration avec le groupe d’Alain Dolla et de F.Guerlesquin) . Le groupe est également impliqué dans le développement d’une plateforme in silico (INT-3D) qui propose aux institutions académiques et aux industries biopharmaceutiques un accompagnement dans le processus d’accélération de recherche de nouvelles molécules bioactives.


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