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Adaptation et réponse aux conditions oxydantes des bactéries anaérobies

par Webmaster - 1er mars 2009

Lorsqu’une cellule se trouve dans des conditions d’environnement particulier, elle tente d’accommoder son métabolisme à ces nouvelles conditions afin de s’y adapter. Lorsque les conditions sont trop perturbantes et les mécanismes de défense ainsi dépassés, la cellule passe dans un état de stress. La réponse de la cellule à un facteur de stress se décompose en plusieurs étapes : la détection de l’agent de stress, l’expression des facteurs de réponse et la formation concomitante d’un réseau d’interactions qui conduit à la réponse effective de la cellule. L’objectif de cet axe thématique est de décomposer ces différentes étapes afin d’en caractériser les composantes. La connaissance des réseaux d’interactions impliqués dans la réponse aux stress, va permettre d’aborder la conception d’effecteurs (activateurs ou inhibiteurs) et ainsi de moduler la réponse cellulaire au stress considéré. Cette approche ouvre la voie à la réalisation de nouveaux outils pour les biologistes où l’accès à des modulateurs de réponse permettra de maîtriser la réponse cellulaire. Cet axe de recherche est développé à travers l’étude des facteurs moléculaires liés à la vie en absence d’oxygène et de la réponse des bactéries anaérobies aux conditions oxydantes.

Le but de ces études est d’identifier les systèmes enzymatiques impliqués ainsi que leurs interactants et de les intégrer dans un réseau d’interactions spécifiques. L’analyse du réseau d’interactions permettra de définir certains nœuds stratégiques pour la modulation de la réponse. Un effort particulier sera mis en œuvre pour définir plus précisément les mécanismes d’interactions entre les acteurs de ces nœuds. Les protéines correspondantes seront produites, leur interactions analysées par des méthodes biophysiques (fluorescence, Résonance Plasmonique de Surface, RMN…) de façon à déterminer les paramètres thermodynamiques et structuraux de la formation des complexes. Certains des nœuds du réseau seront alors ciblés afin de concevoir des effecteurs qui permettront de moduler la réponse cellulaire.


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